Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fndc3bQ6NWW9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fndc3bQ6NWW9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fndc3bQ6NWW9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fndc3bQ6NWW9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fndc3bQ6NWW9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fndc3bQ6NWW9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fndc3bQ6NWW9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fndc3bQ6NWW9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fndc3bQ6NWW9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fndc3bQ6NWW9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fndc3bQ6NWW9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Fndc3bQ6NWW9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Fndc3bQ6NWW9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc3bQ6NWW9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc3bQ6NWW9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc3bQ6NWW9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc3bQ6NWW9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fndc3bQ6NWW9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Fndc3bQ6NWW9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fndc3bQ6NWW9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fndc3bQ6NWW9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fndc3bQ6NWW9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fndc3bQ6NWW9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fndc3bQ6NWW9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fndc3bQ6NWW9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fndc3bQ6NWW9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fndc3bQ6NWW9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fndc3bQ6NWW9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fndc3bQ6NWW9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fndc3bQ6NWW9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fndc3bQ6NWW9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fndc3bQ6NWW9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fndc3bQ6NWW9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fndc3bQ6NWW9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fndc3bQ6NWW9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fndc3bQ6NWW9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fndc3bQ6NWW9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fndc3bQ6NWW9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fndc3bQ6NWW9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fndc3bQ6NWW9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fndc3bQ6NWW9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fndc3bQ6NWW9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fndc3bQ6NWW9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fndc3bQ6NWW9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fndc3bQ6NWW9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fndc3bQ6NWW9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fndc3bQ6NWW9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fndc3bQ6NWW9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fndc3bQ6NWW9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fndc3bQ6NWW9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fndc3bQ6NWW9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fndc3bQ6NWW9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fndc3bQ6NWW9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fndc3bQ6NWW9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fndc3bQ6NWW9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fndc3bQ6NWW9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fndc3bQ6NWW9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Fndc3bQ6NWW9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fndc3bQ6NWW9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fndc3bQ6NWW9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fndc3bQ6NWW9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms