Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NipblQ6KCD5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NipblQ6KCD5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NipblQ6KCD5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms