Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CltbQ6IRU5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CltbQ6IRU5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms