Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nckap5lQ6GQX2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nckap5lQ6GQX2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nckap5lQ6GQX2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nckap5lQ6GQX2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nckap5lQ6GQX2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nckap5lQ6GQX2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nckap5lQ6GQX2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nckap5lQ6GQX2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nckap5lQ6GQX2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Nckap5lQ6GQX2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nckap5lQ6GQX2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Nckap5lQ6GQX2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nckap5lQ6GQX2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nckap5lQ6GQX2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nckap5lQ6GQX2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nckap5lQ6GQX2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nckap5lQ6GQX2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nckap5lQ6GQX2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nckap5lQ6GQX2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nckap5lQ6GQX2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Nckap5lQ6GQX2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nckap5lQ6GQX2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nckap5lQ6GQX2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nckap5lQ6GQX2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nckap5lQ6GQX2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nckap5lQ6GQX2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Nckap5lQ6GQX2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Nckap5lQ6GQX2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Nckap5lQ6GQX2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nckap5lQ6GQX2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nckap5lQ6GQX2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nckap5lQ6GQX2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nckap5lQ6GQX2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nckap5lQ6GQX2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nckap5lQ6GQX2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nckap5lQ6GQX2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nckap5lQ6GQX2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nckap5lQ6GQX2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nckap5lQ6GQX2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nckap5lQ6GQX2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nckap5lQ6GQX2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nckap5lQ6GQX2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nckap5lQ6GQX2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nckap5lQ6GQX2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nckap5lQ6GQX2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nckap5lQ6GQX2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nckap5lQ6GQX2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nckap5lQ6GQX2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nckap5lQ6GQX2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Nckap5lQ6GQX2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Nckap5lQ6GQX2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nckap5lQ6GQX2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nckap5lQ6GQX2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nckap5lQ6GQX2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nckap5lQ6GQX2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nckap5lQ6GQX2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nckap5lQ6GQX2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nckap5lQ6GQX2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nckap5lQ6GQX2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nckap5lQ6GQX2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nckap5lQ6GQX2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nckap5lQ6GQX2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nckap5lQ6GQX2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nckap5lQ6GQX2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nckap5lQ6GQX2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nckap5lQ6GQX2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nckap5lQ6GQX2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nckap5lQ6GQX2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nckap5lQ6GQX2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nckap5lQ6GQX2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nckap5lQ6GQX2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nckap5lQ6GQX2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nckap5lQ6GQX2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nckap5lQ6GQX2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nckap5lQ6GQX2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nckap5lQ6GQX2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nckap5lQ6GQX2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nckap5lQ6GQX2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nckap5lQ6GQX2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Nckap5lQ6GQX2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nckap5lQ6GQX2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nckap5lQ6GQX2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Nckap5lQ6GQX2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nckap5lQ6GQX2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nckap5lQ6GQX2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nckap5lQ6GQX2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nckap5lQ6GQX2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nckap5lQ6GQX2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nckap5lQ6GQX2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nckap5lQ6GQX2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nckap5lQ6GQX2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nckap5lQ6GQX2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nckap5lQ6GQX2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nckap5lQ6GQX2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nckap5lQ6GQX2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nckap5lQ6GQX2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nckap5lQ6GQX2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nckap5lQ6GQX2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nckap5lQ6GQX2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms