Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Atg9bQ6EBV9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg9bQ6EBV9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms