Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scaf8Q6DID3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scaf8Q6DID3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Scaf8Q6DID3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scaf8Q6DID3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scaf8Q6DID3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scaf8Q6DID3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scaf8Q6DID3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scaf8Q6DID3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scaf8Q6DID3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scaf8Q6DID3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scaf8Q6DID3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scaf8Q6DID3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scaf8Q6DID3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scaf8Q6DID3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scaf8Q6DID3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scaf8Q6DID3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scaf8Q6DID3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scaf8Q6DID3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Scaf8Q6DID3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scaf8Q6DID3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scaf8Q6DID3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scaf8Q6DID3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scaf8Q6DID3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scaf8Q6DID3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scaf8Q6DID3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scaf8Q6DID3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scaf8Q6DID3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scaf8Q6DID3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scaf8Q6DID3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scaf8Q6DID3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scaf8Q6DID3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scaf8Q6DID3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scaf8Q6DID3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scaf8Q6DID3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scaf8Q6DID3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scaf8Q6DID3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scaf8Q6DID3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf8Q6DID3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf8Q6DID3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf8Q6DID3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf8Q6DID3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf8Q6DID3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scaf8Q6DID3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scaf8Q6DID3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scaf8Q6DID3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scaf8Q6DID3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Scaf8Q6DID3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scaf8Q6DID3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scaf8Q6DID3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scaf8Q6DID3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scaf8Q6DID3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scaf8Q6DID3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scaf8Q6DID3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scaf8Q6DID3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scaf8Q6DID3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scaf8Q6DID3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scaf8Q6DID3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scaf8Q6DID3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Scaf8Q6DID3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scaf8Q6DID3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scaf8Q6DID3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scaf8Q6DID3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Scaf8Q6DID3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scaf8Q6DID3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms