Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Smarca2Q6DIC0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Smarca2Q6DIC0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Smarca2Q6DIC0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Smarca2Q6DIC0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Smarca2Q6DIC0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
Smarca2Q6DIC0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Smarca2Q6DIC0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Smarca2Q6DIC0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Smarca2Q6DIC0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Smarca2Q6DIC0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.77
Smarca2Q6DIC0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
Smarca2Q6DIC0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Smarca2Q6DIC0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Smarca2Q6DIC0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC38.57■■■■□ 3.77
Smarca2Q6DIC0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
Smarca2Q6DIC0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Smarca2Q6DIC0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Smarca2Q6DIC0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Smarca2Q6DIC0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Smarca2Q6DIC0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Smarca2Q6DIC0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Smarca2Q6DIC0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Smarca2Q6DIC0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Smarca2Q6DIC0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Smarca2Q6DIC0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Smarca2Q6DIC0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Smarca2Q6DIC0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Smarca2Q6DIC0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Smarca2Q6DIC0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Smarca2Q6DIC0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Smarca2Q6DIC0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Smarca2Q6DIC0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Smarca2Q6DIC0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Smarca2Q6DIC0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
Smarca2Q6DIC0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Smarca2Q6DIC0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Smarca2Q6DIC0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Smarca2Q6DIC0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Smarca2Q6DIC0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Smarca2Q6DIC0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Smarca2Q6DIC0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Smarca2Q6DIC0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Smarca2Q6DIC0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Smarca2Q6DIC0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Smarca2Q6DIC0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Smarca2Q6DIC0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Smarca2Q6DIC0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Smarca2Q6DIC0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Smarca2Q6DIC0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Smarca2Q6DIC0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
Smarca2Q6DIC0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Smarca2Q6DIC0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Smarca2Q6DIC0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Smarca2Q6DIC0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Smarca2Q6DIC0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Smarca2Q6DIC0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Smarca2Q6DIC0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Smarca2Q6DIC0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Smarca2Q6DIC0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Smarca2Q6DIC0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Smarca2Q6DIC0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Smarca2Q6DIC0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Smarca2Q6DIC0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Smarca2Q6DIC0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Smarca2Q6DIC0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Smarca2Q6DIC0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Smarca2Q6DIC0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Smarca2Q6DIC0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Smarca2Q6DIC0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Smarca2Q6DIC0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Smarca2Q6DIC0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Smarca2Q6DIC0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Smarca2Q6DIC0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
Smarca2Q6DIC0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Smarca2Q6DIC0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Smarca2Q6DIC0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Smarca2Q6DIC0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Smarca2Q6DIC0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Smarca2Q6DIC0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Smarca2Q6DIC0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Smarca2Q6DIC0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Smarca2Q6DIC0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Smarca2Q6DIC0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Smarca2Q6DIC0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Smarca2Q6DIC0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Smarca2Q6DIC0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Smarca2Q6DIC0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Smarca2Q6DIC0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
Smarca2Q6DIC0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Smarca2Q6DIC0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Smarca2Q6DIC0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Smarca2Q6DIC0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Smarca2Q6DIC0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Smarca2Q6DIC0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Smarca2Q6DIC0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
Smarca2Q6DIC0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Smarca2Q6DIC0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Smarca2Q6DIC0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms