Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nop58Q6DFW4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nop58Q6DFW4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nop58Q6DFW4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nop58Q6DFW4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nop58Q6DFW4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nop58Q6DFW4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nop58Q6DFW4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nop58Q6DFW4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nop58Q6DFW4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nop58Q6DFW4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Nop58Q6DFW4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nop58Q6DFW4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nop58Q6DFW4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nop58Q6DFW4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nop58Q6DFW4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nop58Q6DFW4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Nop58Q6DFW4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nop58Q6DFW4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nop58Q6DFW4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nop58Q6DFW4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nop58Q6DFW4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nop58Q6DFW4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nop58Q6DFW4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nop58Q6DFW4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nop58Q6DFW4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Nop58Q6DFW4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nop58Q6DFW4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nop58Q6DFW4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nop58Q6DFW4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Nop58Q6DFW4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nop58Q6DFW4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nop58Q6DFW4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nop58Q6DFW4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nop58Q6DFW4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nop58Q6DFW4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nop58Q6DFW4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nop58Q6DFW4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nop58Q6DFW4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nop58Q6DFW4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nop58Q6DFW4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nop58Q6DFW4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nop58Q6DFW4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nop58Q6DFW4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nop58Q6DFW4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nop58Q6DFW4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nop58Q6DFW4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nop58Q6DFW4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nop58Q6DFW4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nop58Q6DFW4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nop58Q6DFW4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nop58Q6DFW4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nop58Q6DFW4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nop58Q6DFW4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nop58Q6DFW4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms