Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fndc3c1Q6DFV6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fndc3c1Q6DFV6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fndc3c1Q6DFV6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fndc3c1Q6DFV6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fndc3c1Q6DFV6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fndc3c1Q6DFV6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fndc3c1Q6DFV6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fndc3c1Q6DFV6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fndc3c1Q6DFV6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fndc3c1Q6DFV6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fndc3c1Q6DFV6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fndc3c1Q6DFV6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fndc3c1Q6DFV6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fndc3c1Q6DFV6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fndc3c1Q6DFV6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fndc3c1Q6DFV6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fndc3c1Q6DFV6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fndc3c1Q6DFV6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Fndc3c1Q6DFV6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fndc3c1Q6DFV6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fndc3c1Q6DFV6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fndc3c1Q6DFV6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Fndc3c1Q6DFV6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fndc3c1Q6DFV6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fndc3c1Q6DFV6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fndc3c1Q6DFV6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fndc3c1Q6DFV6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fndc3c1Q6DFV6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fndc3c1Q6DFV6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Fndc3c1Q6DFV6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fndc3c1Q6DFV6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fndc3c1Q6DFV6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fndc3c1Q6DFV6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fndc3c1Q6DFV6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc3c1Q6DFV6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms