Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sv2cQ69ZS6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sv2cQ69ZS6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sv2cQ69ZS6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sv2cQ69ZS6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sv2cQ69ZS6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sv2cQ69ZS6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sv2cQ69ZS6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sv2cQ69ZS6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sv2cQ69ZS6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sv2cQ69ZS6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sv2cQ69ZS6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sv2cQ69ZS6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Sv2cQ69ZS6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sv2cQ69ZS6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sv2cQ69ZS6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sv2cQ69ZS6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sv2cQ69ZS6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sv2cQ69ZS6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sv2cQ69ZS6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sv2cQ69ZS6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sv2cQ69ZS6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sv2cQ69ZS6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sv2cQ69ZS6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sv2cQ69ZS6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sv2cQ69ZS6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sv2cQ69ZS6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sv2cQ69ZS6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sv2cQ69ZS6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sv2cQ69ZS6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sv2cQ69ZS6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sv2cQ69ZS6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sv2cQ69ZS6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sv2cQ69ZS6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sv2cQ69ZS6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sv2cQ69ZS6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sv2cQ69ZS6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sv2cQ69ZS6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sv2cQ69ZS6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sv2cQ69ZS6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sv2cQ69ZS6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sv2cQ69ZS6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sv2cQ69ZS6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sv2cQ69ZS6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Sv2cQ69ZS6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sv2cQ69ZS6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sv2cQ69ZS6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sv2cQ69ZS6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sv2cQ69ZS6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sv2cQ69ZS6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Sv2cQ69ZS6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sv2cQ69ZS6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sv2cQ69ZS6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sv2cQ69ZS6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sv2cQ69ZS6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sv2cQ69ZS6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sv2cQ69ZS6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sv2cQ69ZS6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sv2cQ69ZS6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sv2cQ69ZS6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Sv2cQ69ZS6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sv2cQ69ZS6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sv2cQ69ZS6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms