Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z98

Brsk2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk2Q69Z98 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brsk2Q69Z98 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brsk2Q69Z98 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brsk2Q69Z98 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brsk2Q69Z98 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brsk2Q69Z98 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Brsk2Q69Z98 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brsk2Q69Z98 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Brsk2Q69Z98 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms