Protein–RNA interactions for Protein: Q64455

Ptprj, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, mousemouse

Predictions only

Length 1,238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprjQ64455 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
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PtprjQ64455 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprjQ64455 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprjQ64455 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprjQ64455 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprjQ64455 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprjQ64455 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprjQ64455 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
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PtprjQ64455 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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PtprjQ64455 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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PtprjQ64455 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprjQ64455 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprjQ64455 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprjQ64455 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
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PtprjQ64455 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprjQ64455 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprjQ64455 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprjQ64455 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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PtprjQ64455 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
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PtprjQ64455 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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PtprjQ64455 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprjQ64455 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprjQ64455 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprjQ64455 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
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PtprjQ64455 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtprjQ64455 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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PtprjQ64455 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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PtprjQ64455 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
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PtprjQ64455 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtprjQ64455 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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PtprjQ64455 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
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PtprjQ64455 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprjQ64455 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprjQ64455 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprjQ64455 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprjQ64455 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprjQ64455 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprjQ64455 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprjQ64455 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprjQ64455 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprjQ64455 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprjQ64455 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprjQ64455 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprjQ64455 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprjQ64455 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprjQ64455 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprjQ64455 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprjQ64455 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprjQ64455 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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