Protein–RNA interactions for Protein: Q64332

Syn2, Synapsin-2, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syn2Q64332 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syn2Q64332 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Syn2Q64332 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Syn2Q64332 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Syn2Q64332 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syn2Q64332 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syn2Q64332 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syn2Q64332 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Syn2Q64332 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms