Protein–RNA interactions for Protein: Q64302

Tm4sf1, Transmembrane 4 L6 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf1Q64302 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tm4sf1Q64302 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tm4sf1Q64302 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tm4sf1Q64302 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tm4sf1Q64302 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tm4sf1Q64302 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tm4sf1Q64302 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tm4sf1Q64302 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tm4sf1Q64302 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tm4sf1Q64302 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tm4sf1Q64302 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tm4sf1Q64302 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tm4sf1Q64302 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tm4sf1Q64302 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tm4sf1Q64302 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tm4sf1Q64302 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tm4sf1Q64302 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tm4sf1Q64302 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tm4sf1Q64302 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tm4sf1Q64302 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tm4sf1Q64302 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tm4sf1Q64302 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tm4sf1Q64302 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tm4sf1Q64302 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tm4sf1Q64302 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tm4sf1Q64302 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tm4sf1Q64302 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tm4sf1Q64302 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tm4sf1Q64302 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tm4sf1Q64302 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tm4sf1Q64302 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tm4sf1Q64302 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tm4sf1Q64302 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tm4sf1Q64302 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tm4sf1Q64302 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tm4sf1Q64302 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tm4sf1Q64302 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tm4sf1Q64302 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tm4sf1Q64302 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tm4sf1Q64302 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tm4sf1Q64302 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tm4sf1Q64302 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tm4sf1Q64302 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tm4sf1Q64302 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tm4sf1Q64302 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tm4sf1Q64302 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tm4sf1Q64302 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tm4sf1Q64302 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tm4sf1Q64302 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tm4sf1Q64302 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tm4sf1Q64302 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tm4sf1Q64302 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tm4sf1Q64302 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tm4sf1Q64302 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tm4sf1Q64302 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tm4sf1Q64302 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tm4sf1Q64302 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tm4sf1Q64302 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tm4sf1Q64302 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 214.9 ms