Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.3
Ccdc18Q640L5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Ccdc18Q640L5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Ccdc18Q640L5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Ccdc18Q640L5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Ccdc18Q640L5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Ccdc18Q640L5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Ccdc18Q640L5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Ccdc18Q640L5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
Ccdc18Q640L5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Ccdc18Q640L5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Ccdc18Q640L5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Ccdc18Q640L5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Ccdc18Q640L5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Ccdc18Q640L5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Ccdc18Q640L5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Ccdc18Q640L5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Ccdc18Q640L5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Ccdc18Q640L5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ccdc18Q640L5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ccdc18Q640L5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ccdc18Q640L5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ccdc18Q640L5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ccdc18Q640L5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Ccdc18Q640L5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ccdc18Q640L5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ccdc18Q640L5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ccdc18Q640L5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ccdc18Q640L5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ccdc18Q640L5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ccdc18Q640L5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ccdc18Q640L5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ccdc18Q640L5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ccdc18Q640L5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ccdc18Q640L5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Ccdc18Q640L5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Ccdc18Q640L5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ccdc18Q640L5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ccdc18Q640L5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Ccdc18Q640L5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Ccdc18Q640L5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
Ccdc18Q640L5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
Ccdc18Q640L5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Ccdc18Q640L5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Ccdc18Q640L5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Ccdc18Q640L5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Ccdc18Q640L5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Ccdc18Q640L5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ccdc18Q640L5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ccdc18Q640L5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ccdc18Q640L5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ccdc18Q640L5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ccdc18Q640L5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ccdc18Q640L5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ccdc18Q640L5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ccdc18Q640L5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ccdc18Q640L5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ccdc18Q640L5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ccdc18Q640L5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ccdc18Q640L5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ccdc18Q640L5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Ccdc18Q640L5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ccdc18Q640L5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ccdc18Q640L5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ccdc18Q640L5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ccdc18Q640L5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Ccdc18Q640L5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Ccdc18Q640L5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Ccdc18Q640L5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Ccdc18Q640L5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Ccdc18Q640L5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ccdc18Q640L5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ccdc18Q640L5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Ccdc18Q640L5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Ccdc18Q640L5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Ccdc18Q640L5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Ccdc18Q640L5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Ccdc18Q640L5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Ccdc18Q640L5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ccdc18Q640L5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ccdc18Q640L5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ccdc18Q640L5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ccdc18Q640L5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Ccdc18Q640L5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ccdc18Q640L5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ccdc18Q640L5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ccdc18Q640L5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Ccdc18Q640L5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Ccdc18Q640L5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Ccdc18Q640L5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Ccdc18Q640L5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ccdc18Q640L5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ccdc18Q640L5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ccdc18Q640L5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ccdc18Q640L5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ccdc18Q640L5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ccdc18Q640L5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ccdc18Q640L5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ccdc18Q640L5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ccdc18Q640L5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
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