Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vamp1Q62442 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp1Q62442 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms