Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tff3Q62395 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms