Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpd52Q62393 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpd52Q62393 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tpd52Q62393 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpd52Q62393 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpd52Q62393 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpd52Q62393 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpd52Q62393 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpd52Q62393 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpd52Q62393 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpd52Q62393 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Tpd52Q62393 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpd52Q62393 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpd52Q62393 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpd52Q62393 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpd52Q62393 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpd52Q62393 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpd52Q62393 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpd52Q62393 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpd52Q62393 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms