Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TrhQ62361 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TrhQ62361 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TrhQ62361 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TrhQ62361 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TrhQ62361 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TrhQ62361 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TrhQ62361 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TrhQ62361 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TrhQ62361 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TrhQ62361 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TrhQ62361 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TrhQ62361 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TrhQ62361 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TrhQ62361 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TrhQ62361 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TrhQ62361 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TrhQ62361 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TrhQ62361 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TrhQ62361 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TrhQ62361 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TrhQ62361 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TrhQ62361 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TrhQ62361 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TrhQ62361 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TrhQ62361 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TrhQ62361 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TrhQ62361 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TrhQ62361 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TrhQ62361 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TrhQ62361 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TrhQ62361 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TrhQ62361 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TrhQ62361 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TrhQ62361 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TrhQ62361 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TrhQ62361 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TrhQ62361 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TrhQ62361 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TrhQ62361 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TrhQ62361 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TrhQ62361 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TrhQ62361 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TrhQ62361 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TrhQ62361 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TrhQ62361 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TrhQ62361 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TrhQ62361 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TrhQ62361 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TrhQ62361 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TrhQ62361 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TrhQ62361 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TrhQ62361 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TrhQ62361 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TrhQ62361 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TrhQ62361 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TrhQ62361 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TrhQ62361 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TrhQ62361 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TrhQ62361 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TrhQ62361 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TrhQ62361 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TrhQ62361 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TrhQ62361 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TrhQ62361 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TrhQ62361 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TrhQ62361 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TrhQ62361 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TrhQ62361 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TrhQ62361 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TrhQ62361 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TrhQ62361 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TrhQ62361 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TrhQ62361 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TrhQ62361 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TrhQ62361 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TrhQ62361 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TrhQ62361 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TrhQ62361 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TrhQ62361 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TrhQ62361 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TrhQ62361 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TrhQ62361 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TrhQ62361 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TrhQ62361 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TrhQ62361 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TrhQ62361 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TrhQ62361 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TrhQ62361 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TrhQ62361 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TrhQ62361 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TrhQ62361 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TrhQ62361 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms