Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SypQ62277 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SypQ62277 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SypQ62277 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SypQ62277 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SypQ62277 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SypQ62277 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SypQ62277 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SypQ62277 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SypQ62277 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SypQ62277 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SypQ62277 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SypQ62277 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SypQ62277 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SypQ62277 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SypQ62277 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SypQ62277 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SypQ62277 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SypQ62277 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SypQ62277 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SypQ62277 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SypQ62277 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SypQ62277 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SypQ62277 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SypQ62277 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SypQ62277 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SypQ62277 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SypQ62277 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SypQ62277 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SypQ62277 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SypQ62277 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SypQ62277 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SypQ62277 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SypQ62277 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SypQ62277 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SypQ62277 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SypQ62277 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SypQ62277 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SypQ62277 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SypQ62277 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SypQ62277 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SypQ62277 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SypQ62277 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SypQ62277 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SypQ62277 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SypQ62277 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SypQ62277 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SypQ62277 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SypQ62277 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SypQ62277 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SypQ62277 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SypQ62277 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SypQ62277 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SypQ62277 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SypQ62277 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SypQ62277 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SypQ62277 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SypQ62277 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SypQ62277 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SypQ62277 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SypQ62277 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SypQ62277 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SypQ62277 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SypQ62277 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SypQ62277 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SypQ62277 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SypQ62277 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SypQ62277 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SypQ62277 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SypQ62277 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SypQ62277 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SypQ62277 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SypQ62277 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SypQ62277 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SypQ62277 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SypQ62277 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SypQ62277 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SypQ62277 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SypQ62277 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SypQ62277 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SypQ62277 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SypQ62277 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SypQ62277 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SypQ62277 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SypQ62277 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SypQ62277 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SypQ62277 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SypQ62277 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SypQ62277 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SypQ62277 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SypQ62277 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SypQ62277 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SypQ62277 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SypQ62277 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SypQ62277 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SypQ62277 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SypQ62277 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SypQ62277 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SypQ62277 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SypQ62277 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms