Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Sall3Q62255 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sall3Q62255 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sall3Q62255 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Sall3Q62255 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Sall3Q62255 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Sall3Q62255 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sall3Q62255 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sall3Q62255 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sall3Q62255 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sall3Q62255 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sall3Q62255 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sall3Q62255 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Sall3Q62255 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Sall3Q62255 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sall3Q62255 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sall3Q62255 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Sall3Q62255 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Sall3Q62255 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Sall3Q62255 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Sall3Q62255 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sall3Q62255 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sall3Q62255 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sall3Q62255 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sall3Q62255 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Sall3Q62255 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sall3Q62255 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sall3Q62255 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sall3Q62255 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sall3Q62255 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sall3Q62255 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Sall3Q62255 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Sall3Q62255 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Sall3Q62255 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Sall3Q62255 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Sall3Q62255 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Sall3Q62255 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Sall3Q62255 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Sall3Q62255 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Sall3Q62255 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Sall3Q62255 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Sall3Q62255 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Sall3Q62255 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Sall3Q62255 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Sall3Q62255 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Sall3Q62255 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Sall3Q62255 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Sall3Q62255 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Sall3Q62255 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Sall3Q62255 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Sall3Q62255 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Sall3Q62255 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Sall3Q62255 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Sall3Q62255 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Sall3Q62255 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Sall3Q62255 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Sall3Q62255 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Sall3Q62255 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Sall3Q62255 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Sall3Q62255 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Sall3Q62255 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Sall3Q62255 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Sall3Q62255 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Sall3Q62255 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Sall3Q62255 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Sall3Q62255 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Sall3Q62255 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Sall3Q62255 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Sall3Q62255 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Sall3Q62255 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Sall3Q62255 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Sall3Q62255 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Sall3Q62255 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sall3Q62255 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sall3Q62255 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sall3Q62255 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sall3Q62255 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sall3Q62255 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Sall3Q62255 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Sall3Q62255 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Sall3Q62255 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Sall3Q62255 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Sall3Q62255 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Sall3Q62255 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Sall3Q62255 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Sall3Q62255 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Sall3Q62255 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Sall3Q62255 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Sall3Q62255 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Sall3Q62255 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Sall3Q62255 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Sall3Q62255 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Sall3Q62255 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Sall3Q62255 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Sall3Q62255 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Sall3Q62255 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Sall3Q62255 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Sall3Q62255 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Sall3Q62255 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Sall3Q62255 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms