Protein–RNA interactions for Protein: Q62179

Sema4b, Semaphorin-4B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4bQ62179 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sema4bQ62179 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sema4bQ62179 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema4bQ62179 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms