Protein–RNA interactions for Protein: Q62167

Ddx3x, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx3xQ62167 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx3xQ62167 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx3xQ62167 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ddx3xQ62167 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx3xQ62167 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx3xQ62167 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx3xQ62167 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx3xQ62167 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx3xQ62167 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx3xQ62167 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx3xQ62167 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx3xQ62167 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx3xQ62167 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx3xQ62167 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx3xQ62167 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx3xQ62167 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx3xQ62167 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx3xQ62167 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx3xQ62167 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx3xQ62167 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx3xQ62167 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx3xQ62167 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx3xQ62167 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx3xQ62167 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx3xQ62167 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx3xQ62167 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx3xQ62167 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx3xQ62167 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx3xQ62167 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx3xQ62167 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx3xQ62167 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx3xQ62167 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx3xQ62167 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx3xQ62167 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx3xQ62167 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx3xQ62167 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx3xQ62167 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx3xQ62167 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx3xQ62167 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx3xQ62167 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx3xQ62167 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx3xQ62167 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ddx3xQ62167 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ddx3xQ62167 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms