Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Aldh1a2Q62148 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aldh1a2Q62148 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aldh1a2Q62148 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms