Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ctr9Q62018 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ctr9Q62018 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ctr9Q62018 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ctr9Q62018 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctr9Q62018 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctr9Q62018 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctr9Q62018 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctr9Q62018 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctr9Q62018 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctr9Q62018 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctr9Q62018 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctr9Q62018 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctr9Q62018 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctr9Q62018 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctr9Q62018 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ctr9Q62018 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ctr9Q62018 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctr9Q62018 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctr9Q62018 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctr9Q62018 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctr9Q62018 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctr9Q62018 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctr9Q62018 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctr9Q62018 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctr9Q62018 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctr9Q62018 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctr9Q62018 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctr9Q62018 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctr9Q62018 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctr9Q62018 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctr9Q62018 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctr9Q62018 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctr9Q62018 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ctr9Q62018 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctr9Q62018 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctr9Q62018 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctr9Q62018 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctr9Q62018 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctr9Q62018 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctr9Q62018 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctr9Q62018 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctr9Q62018 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctr9Q62018 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctr9Q62018 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctr9Q62018 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctr9Q62018 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctr9Q62018 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctr9Q62018 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctr9Q62018 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctr9Q62018 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctr9Q62018 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctr9Q62018 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctr9Q62018 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctr9Q62018 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctr9Q62018 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctr9Q62018 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctr9Q62018 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctr9Q62018 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctr9Q62018 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctr9Q62018 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctr9Q62018 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctr9Q62018 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctr9Q62018 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms