Protein–RNA interactions for Protein: Q61805

Lbp, Lipopolysaccharide-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbpQ61805 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LbpQ61805 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LbpQ61805 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LbpQ61805 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LbpQ61805 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LbpQ61805 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LbpQ61805 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LbpQ61805 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LbpQ61805 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LbpQ61805 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LbpQ61805 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LbpQ61805 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LbpQ61805 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LbpQ61805 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LbpQ61805 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LbpQ61805 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LbpQ61805 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LbpQ61805 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LbpQ61805 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LbpQ61805 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LbpQ61805 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LbpQ61805 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LbpQ61805 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LbpQ61805 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LbpQ61805 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LbpQ61805 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LbpQ61805 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LbpQ61805 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LbpQ61805 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LbpQ61805 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LbpQ61805 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LbpQ61805 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LbpQ61805 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LbpQ61805 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LbpQ61805 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LbpQ61805 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LbpQ61805 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LbpQ61805 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LbpQ61805 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LbpQ61805 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LbpQ61805 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LbpQ61805 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LbpQ61805 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LbpQ61805 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LbpQ61805 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LbpQ61805 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LbpQ61805 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LbpQ61805 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LbpQ61805 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LbpQ61805 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LbpQ61805 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LbpQ61805 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LbpQ61805 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LbpQ61805 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LbpQ61805 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LbpQ61805 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LbpQ61805 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LbpQ61805 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LbpQ61805 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LbpQ61805 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LbpQ61805 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LbpQ61805 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LbpQ61805 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LbpQ61805 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LbpQ61805 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LbpQ61805 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LbpQ61805 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LbpQ61805 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LbpQ61805 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LbpQ61805 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LbpQ61805 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LbpQ61805 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LbpQ61805 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LbpQ61805 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms