Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lama3Q61789 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lama3Q61789 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lama3Q61789 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lama3Q61789 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lama3Q61789 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lama3Q61789 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Lama3Q61789 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lama3Q61789 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lama3Q61789 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lama3Q61789 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lama3Q61789 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lama3Q61789 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lama3Q61789 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lama3Q61789 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lama3Q61789 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lama3Q61789 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lama3Q61789 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lama3Q61789 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lama3Q61789 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lama3Q61789 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lama3Q61789 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lama3Q61789 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lama3Q61789 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lama3Q61789 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lama3Q61789 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lama3Q61789 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Lama3Q61789 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lama3Q61789 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lama3Q61789 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lama3Q61789 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lama3Q61789 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lama3Q61789 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lama3Q61789 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lama3Q61789 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lama3Q61789 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lama3Q61789 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms