Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pacsin1Q61644 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms