Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ecm1Q61508 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ecm1Q61508 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ecm1Q61508 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ecm1Q61508 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ecm1Q61508 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ecm1Q61508 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ecm1Q61508 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ecm1Q61508 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ecm1Q61508 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ecm1Q61508 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ecm1Q61508 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ecm1Q61508 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ecm1Q61508 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ecm1Q61508 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm1Q61508 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm1Q61508 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm1Q61508 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm1Q61508 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm1Q61508 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm1Q61508 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm1Q61508 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ecm1Q61508 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ecm1Q61508 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm1Q61508 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm1Q61508 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm1Q61508 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm1Q61508 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm1Q61508 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm1Q61508 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm1Q61508 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Ecm1Q61508 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ecm1Q61508 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ecm1Q61508 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ecm1Q61508 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ecm1Q61508 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ecm1Q61508 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ecm1Q61508 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ecm1Q61508 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ecm1Q61508 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ecm1Q61508 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ecm1Q61508 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ecm1Q61508 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ecm1Q61508 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ecm1Q61508 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ecm1Q61508 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ecm1Q61508 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ecm1Q61508 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ecm1Q61508 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ecm1Q61508 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ecm1Q61508 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ecm1Q61508 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ecm1Q61508 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ecm1Q61508 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ecm1Q61508 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ecm1Q61508 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ecm1Q61508 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ecm1Q61508 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ecm1Q61508 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ecm1Q61508 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ecm1Q61508 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ecm1Q61508 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ecm1Q61508 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ecm1Q61508 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ecm1Q61508 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ecm1Q61508 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ecm1Q61508 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ecm1Q61508 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ecm1Q61508 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ecm1Q61508 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ecm1Q61508 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ecm1Q61508 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ecm1Q61508 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ecm1Q61508 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ecm1Q61508 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ecm1Q61508 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ecm1Q61508 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ecm1Q61508 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ecm1Q61508 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ecm1Q61508 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ecm1Q61508 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ecm1Q61508 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ecm1Q61508 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ecm1Q61508 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ecm1Q61508 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ecm1Q61508 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms