Protein–RNA interactions for Protein: Q61187

Tsg101, Tumor susceptibility gene 101 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsg101Q61187 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsg101Q61187 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tsg101Q61187 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsg101Q61187 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms