Protein–RNA interactions for Protein: Q61068

Usp17la, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein A, mousemouse

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Length 526 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17laQ61068 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp17laQ61068 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp17laQ61068 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp17laQ61068 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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