Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
JrkQ60976 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
JrkQ60976 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
JrkQ60976 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
JrkQ60976 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
JrkQ60976 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
JrkQ60976 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 404.8 ms