Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rbbp7Q60973 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbbp7Q60973 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 268.9 ms