Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Foxd4Q60688 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxd4Q60688 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxd4Q60688 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxd4Q60688 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms