Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ItgaeQ60677 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ItgaeQ60677 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ItgaeQ60677 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms