Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprnQ60673 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprnQ60673 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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PtprnQ60673 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprnQ60673 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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PtprnQ60673 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprnQ60673 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprnQ60673 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprnQ60673 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprnQ60673 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprnQ60673 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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PtprnQ60673 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprnQ60673 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprnQ60673 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprnQ60673 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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PtprnQ60673 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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PtprnQ60673 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprnQ60673 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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PtprnQ60673 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprnQ60673 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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PtprnQ60673 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprnQ60673 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PtprnQ60673 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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PtprnQ60673 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprnQ60673 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprnQ60673 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprnQ60673 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprnQ60673 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprnQ60673 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprnQ60673 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprnQ60673 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprnQ60673 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprnQ60673 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprnQ60673 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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PtprnQ60673 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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PtprnQ60673 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprnQ60673 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprnQ60673 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprnQ60673 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprnQ60673 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprnQ60673 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprnQ60673 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprnQ60673 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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PtprnQ60673 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms