Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CttnQ60598 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CttnQ60598 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CttnQ60598 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CttnQ60598 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CttnQ60598 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CttnQ60598 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CttnQ60598 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CttnQ60598 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CttnQ60598 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CttnQ60598 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CttnQ60598 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CttnQ60598 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CttnQ60598 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CttnQ60598 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CttnQ60598 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CttnQ60598 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CttnQ60598 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CttnQ60598 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CttnQ60598 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CttnQ60598 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CttnQ60598 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CttnQ60598 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CttnQ60598 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CttnQ60598 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CttnQ60598 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CttnQ60598 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CttnQ60598 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CttnQ60598 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CttnQ60598 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CttnQ60598 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CttnQ60598 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CttnQ60598 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CttnQ60598 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CttnQ60598 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CttnQ60598 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CttnQ60598 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CttnQ60598 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CttnQ60598 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CttnQ60598 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CttnQ60598 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CttnQ60598 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CttnQ60598 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CttnQ60598 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CttnQ60598 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms