Protein–RNA interactions for Protein: Q5UW37

Cxcl17, C-X-C motif chemokine 17, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl17Q5UW37 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cxcl17Q5UW37 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cxcl17Q5UW37 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cxcl17Q5UW37 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cxcl17Q5UW37 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cxcl17Q5UW37 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cxcl17Q5UW37 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cxcl17Q5UW37 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cxcl17Q5UW37 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cxcl17Q5UW37 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cxcl17Q5UW37 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cxcl17Q5UW37 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cxcl17Q5UW37 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cxcl17Q5UW37 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cxcl17Q5UW37 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cxcl17Q5UW37 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cxcl17Q5UW37 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cxcl17Q5UW37 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cxcl17Q5UW37 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cxcl17Q5UW37 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cxcl17Q5UW37 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cxcl17Q5UW37 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cxcl17Q5UW37 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cxcl17Q5UW37 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cxcl17Q5UW37 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cxcl17Q5UW37 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cxcl17Q5UW37 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cxcl17Q5UW37 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cxcl17Q5UW37 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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Cxcl17Q5UW37 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cxcl17Q5UW37 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cxcl17Q5UW37 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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Cxcl17Q5UW37 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cxcl17Q5UW37 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cxcl17Q5UW37 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cxcl17Q5UW37 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cxcl17Q5UW37 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
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Cxcl17Q5UW37 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cxcl17Q5UW37 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 291.5 ms