Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Scaf1Q5U4C3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Scaf1Q5U4C3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Scaf1Q5U4C3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Scaf1Q5U4C3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Scaf1Q5U4C3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Scaf1Q5U4C3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Scaf1Q5U4C3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Scaf1Q5U4C3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Scaf1Q5U4C3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Scaf1Q5U4C3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Scaf1Q5U4C3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Scaf1Q5U4C3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Scaf1Q5U4C3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Scaf1Q5U4C3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Scaf1Q5U4C3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Scaf1Q5U4C3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Scaf1Q5U4C3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Scaf1Q5U4C3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Scaf1Q5U4C3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Scaf1Q5U4C3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Scaf1Q5U4C3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Scaf1Q5U4C3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Scaf1Q5U4C3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Scaf1Q5U4C3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Scaf1Q5U4C3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Scaf1Q5U4C3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Scaf1Q5U4C3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Scaf1Q5U4C3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Scaf1Q5U4C3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Scaf1Q5U4C3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Scaf1Q5U4C3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Scaf1Q5U4C3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Scaf1Q5U4C3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Scaf1Q5U4C3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Scaf1Q5U4C3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Scaf1Q5U4C3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Scaf1Q5U4C3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Scaf1Q5U4C3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Scaf1Q5U4C3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Scaf1Q5U4C3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Scaf1Q5U4C3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Scaf1Q5U4C3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Scaf1Q5U4C3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Scaf1Q5U4C3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Scaf1Q5U4C3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Scaf1Q5U4C3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Scaf1Q5U4C3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Scaf1Q5U4C3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Scaf1Q5U4C3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Scaf1Q5U4C3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Scaf1Q5U4C3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Scaf1Q5U4C3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Scaf1Q5U4C3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Scaf1Q5U4C3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Scaf1Q5U4C3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Scaf1Q5U4C3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Scaf1Q5U4C3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Scaf1Q5U4C3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Scaf1Q5U4C3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Scaf1Q5U4C3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Scaf1Q5U4C3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Scaf1Q5U4C3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Scaf1Q5U4C3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Scaf1Q5U4C3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Scaf1Q5U4C3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Scaf1Q5U4C3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Scaf1Q5U4C3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Scaf1Q5U4C3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Scaf1Q5U4C3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Scaf1Q5U4C3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Scaf1Q5U4C3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Scaf1Q5U4C3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Scaf1Q5U4C3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Scaf1Q5U4C3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Scaf1Q5U4C3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Scaf1Q5U4C3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Scaf1Q5U4C3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Scaf1Q5U4C3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Scaf1Q5U4C3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Scaf1Q5U4C3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Scaf1Q5U4C3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Scaf1Q5U4C3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Scaf1Q5U4C3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Scaf1Q5U4C3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Scaf1Q5U4C3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Scaf1Q5U4C3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Scaf1Q5U4C3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Scaf1Q5U4C3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Scaf1Q5U4C3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Scaf1Q5U4C3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Scaf1Q5U4C3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Scaf1Q5U4C3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Scaf1Q5U4C3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Scaf1Q5U4C3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Scaf1Q5U4C3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Scaf1Q5U4C3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Scaf1Q5U4C3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Scaf1Q5U4C3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Scaf1Q5U4C3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms