Protein–RNA interactions for Protein: Q5U467

Fbxw20, F-box and WD-40 domain protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw20Q5U467 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fbxw20Q5U467 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fbxw20Q5U467 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fbxw20Q5U467 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fbxw20Q5U467 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fbxw20Q5U467 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fbxw20Q5U467 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fbxw20Q5U467 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fbxw20Q5U467 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fbxw20Q5U467 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fbxw20Q5U467 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fbxw20Q5U467 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fbxw20Q5U467 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fbxw20Q5U467 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fbxw20Q5U467 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fbxw20Q5U467 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fbxw20Q5U467 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fbxw20Q5U467 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Fbxw20Q5U467 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fbxw20Q5U467 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fbxw20Q5U467 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fbxw20Q5U467 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fbxw20Q5U467 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fbxw20Q5U467 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fbxw20Q5U467 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Fbxw20Q5U467 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Fbxw20Q5U467 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fbxw20Q5U467 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fbxw20Q5U467 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Fbxw20Q5U467 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Fbxw20Q5U467 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fbxw20Q5U467 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxw20Q5U467 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxw20Q5U467 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxw20Q5U467 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxw20Q5U467 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxw20Q5U467 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxw20Q5U467 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxw20Q5U467 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxw20Q5U467 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fbxw20Q5U467 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Fbxw20Q5U467 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Fbxw20Q5U467 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fbxw20Q5U467 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fbxw20Q5U467 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fbxw20Q5U467 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fbxw20Q5U467 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fbxw20Q5U467 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Fbxw20Q5U467 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fbxw20Q5U467 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms