Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdcp1Q5U462 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdcp1Q5U462 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdcp1Q5U462 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdcp1Q5U462 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdcp1Q5U462 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdcp1Q5U462 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdcp1Q5U462 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdcp1Q5U462 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdcp1Q5U462 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdcp1Q5U462 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdcp1Q5U462 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdcp1Q5U462 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdcp1Q5U462 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdcp1Q5U462 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdcp1Q5U462 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdcp1Q5U462 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdcp1Q5U462 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdcp1Q5U462 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdcp1Q5U462 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdcp1Q5U462 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdcp1Q5U462 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdcp1Q5U462 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdcp1Q5U462 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdcp1Q5U462 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdcp1Q5U462 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdcp1Q5U462 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdcp1Q5U462 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdcp1Q5U462 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdcp1Q5U462 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdcp1Q5U462 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdcp1Q5U462 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdcp1Q5U462 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdcp1Q5U462 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdcp1Q5U462 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdcp1Q5U462 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdcp1Q5U462 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdcp1Q5U462 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdcp1Q5U462 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdcp1Q5U462 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdcp1Q5U462 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdcp1Q5U462 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdcp1Q5U462 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdcp1Q5U462 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdcp1Q5U462 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdcp1Q5U462 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdcp1Q5U462 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdcp1Q5U462 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdcp1Q5U462 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdcp1Q5U462 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdcp1Q5U462 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdcp1Q5U462 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdcp1Q5U462 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdcp1Q5U462 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdcp1Q5U462 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdcp1Q5U462 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdcp1Q5U462 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdcp1Q5U462 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdcp1Q5U462 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdcp1Q5U462 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms