Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
NacadQ5SWP3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
NacadQ5SWP3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
NacadQ5SWP3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
NacadQ5SWP3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
NacadQ5SWP3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
NacadQ5SWP3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
NacadQ5SWP3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
NacadQ5SWP3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
NacadQ5SWP3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
NacadQ5SWP3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
NacadQ5SWP3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
NacadQ5SWP3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
NacadQ5SWP3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
NacadQ5SWP3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
NacadQ5SWP3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
NacadQ5SWP3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
NacadQ5SWP3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
NacadQ5SWP3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
NacadQ5SWP3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
NacadQ5SWP3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
NacadQ5SWP3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
NacadQ5SWP3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
NacadQ5SWP3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
NacadQ5SWP3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
NacadQ5SWP3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
NacadQ5SWP3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
NacadQ5SWP3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
NacadQ5SWP3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
NacadQ5SWP3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
NacadQ5SWP3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
NacadQ5SWP3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
NacadQ5SWP3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
NacadQ5SWP3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
NacadQ5SWP3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
NacadQ5SWP3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
NacadQ5SWP3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
NacadQ5SWP3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
NacadQ5SWP3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
NacadQ5SWP3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC41.14■■■■■ 4.18
NacadQ5SWP3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
NacadQ5SWP3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.18
NacadQ5SWP3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
NacadQ5SWP3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
NacadQ5SWP3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
NacadQ5SWP3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
NacadQ5SWP3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
NacadQ5SWP3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
NacadQ5SWP3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
NacadQ5SWP3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
NacadQ5SWP3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
NacadQ5SWP3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
NacadQ5SWP3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC41.07■■■■■ 4.16
NacadQ5SWP3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
NacadQ5SWP3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
NacadQ5SWP3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
NacadQ5SWP3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC41.05■■■■■ 4.16
NacadQ5SWP3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
NacadQ5SWP3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
NacadQ5SWP3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
NacadQ5SWP3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
NacadQ5SWP3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
NacadQ5SWP3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
NacadQ5SWP3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
NacadQ5SWP3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
NacadQ5SWP3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
NacadQ5SWP3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
NacadQ5SWP3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
NacadQ5SWP3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
NacadQ5SWP3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
NacadQ5SWP3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
NacadQ5SWP3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
NacadQ5SWP3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
NacadQ5SWP3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
NacadQ5SWP3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
NacadQ5SWP3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
NacadQ5SWP3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
NacadQ5SWP3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
NacadQ5SWP3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
NacadQ5SWP3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
NacadQ5SWP3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41■■■■■ 4.15
NacadQ5SWP3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC41■■■■■ 4.15
NacadQ5SWP3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
NacadQ5SWP3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
NacadQ5SWP3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
NacadQ5SWP3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
NacadQ5SWP3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
NacadQ5SWP3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
NacadQ5SWP3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
NacadQ5SWP3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
NacadQ5SWP3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
NacadQ5SWP3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
NacadQ5SWP3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
NacadQ5SWP3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
NacadQ5SWP3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
NacadQ5SWP3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
NacadQ5SWP3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
NacadQ5SWP3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
NacadQ5SWP3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
NacadQ5SWP3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms