Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUR0

Pfas, Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfasQ5SUR0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PfasQ5SUR0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PfasQ5SUR0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PfasQ5SUR0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PfasQ5SUR0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PfasQ5SUR0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PfasQ5SUR0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PfasQ5SUR0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PfasQ5SUR0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PfasQ5SUR0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PfasQ5SUR0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PfasQ5SUR0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PfasQ5SUR0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PfasQ5SUR0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PfasQ5SUR0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PfasQ5SUR0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PfasQ5SUR0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PfasQ5SUR0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PfasQ5SUR0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PfasQ5SUR0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PfasQ5SUR0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PfasQ5SUR0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PfasQ5SUR0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PfasQ5SUR0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PfasQ5SUR0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.7 ms