Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm11487Q5RIS0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm11487Q5RIS0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm11487Q5RIS0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm11487Q5RIS0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm11487Q5RIS0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm11487Q5RIS0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm11487Q5RIS0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm11487Q5RIS0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm11487Q5RIS0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm11487Q5RIS0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm11487Q5RIS0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm11487Q5RIS0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm11487Q5RIS0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm11487Q5RIS0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm11487Q5RIS0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm11487Q5RIS0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm11487Q5RIS0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm11487Q5RIS0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm11487Q5RIS0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm11487Q5RIS0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm11487Q5RIS0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm11487Q5RIS0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm11487Q5RIS0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm11487Q5RIS0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm11487Q5RIS0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm11487Q5RIS0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm11487Q5RIS0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm11487Q5RIS0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm11487Q5RIS0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm11487Q5RIS0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm11487Q5RIS0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm11487Q5RIS0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm11487Q5RIS0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm11487Q5RIS0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm11487Q5RIS0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm11487Q5RIS0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm11487Q5RIS0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm11487Q5RIS0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm11487Q5RIS0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm11487Q5RIS0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm11487Q5RIS0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm11487Q5RIS0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm11487Q5RIS0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm11487Q5RIS0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm11487Q5RIS0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm11487Q5RIS0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm11487Q5RIS0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm11487Q5RIS0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm11487Q5RIS0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm11487Q5RIS0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm11487Q5RIS0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm11487Q5RIS0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm11487Q5RIS0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm11487Q5RIS0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm11487Q5RIS0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm11487Q5RIS0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm11487Q5RIS0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm11487Q5RIS0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm11487Q5RIS0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm11487Q5RIS0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm11487Q5RIS0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms