Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1C3

Trav3-3, T cell receptor alpha variable 3-3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav3-3Q5R1C3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trav3-3Q5R1C3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trav3-3Q5R1C3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms