Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trdv4Q5R1A3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trdv4Q5R1A3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trdv4Q5R1A3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms