Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RilpQ5ND29 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RilpQ5ND29 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RilpQ5ND29 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RilpQ5ND29 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RilpQ5ND29 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms