Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCR9

Nsrp1, Nuclear speckle splicing regulatory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsrp1Q5NCR9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nsrp1Q5NCR9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nsrp1Q5NCR9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nsrp1Q5NCR9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nsrp1Q5NCR9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nsrp1Q5NCR9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nsrp1Q5NCR9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nsrp1Q5NCR9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nsrp1Q5NCR9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nsrp1Q5NCR9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nsrp1Q5NCR9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nsrp1Q5NCR9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nsrp1Q5NCR9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nsrp1Q5NCR9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nsrp1Q5NCR9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nsrp1Q5NCR9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nsrp1Q5NCR9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nsrp1Q5NCR9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nsrp1Q5NCR9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nsrp1Q5NCR9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nsrp1Q5NCR9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nsrp1Q5NCR9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nsrp1Q5NCR9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nsrp1Q5NCR9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nsrp1Q5NCR9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nsrp1Q5NCR9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nsrp1Q5NCR9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nsrp1Q5NCR9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nsrp1Q5NCR9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nsrp1Q5NCR9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nsrp1Q5NCR9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nsrp1Q5NCR9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nsrp1Q5NCR9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nsrp1Q5NCR9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nsrp1Q5NCR9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nsrp1Q5NCR9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nsrp1Q5NCR9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nsrp1Q5NCR9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nsrp1Q5NCR9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nsrp1Q5NCR9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nsrp1Q5NCR9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nsrp1Q5NCR9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nsrp1Q5NCR9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nsrp1Q5NCR9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nsrp1Q5NCR9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nsrp1Q5NCR9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nsrp1Q5NCR9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nsrp1Q5NCR9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nsrp1Q5NCR9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nsrp1Q5NCR9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nsrp1Q5NCR9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nsrp1Q5NCR9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nsrp1Q5NCR9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Nsrp1Q5NCR9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nsrp1Q5NCR9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nsrp1Q5NCR9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nsrp1Q5NCR9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nsrp1Q5NCR9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nsrp1Q5NCR9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nsrp1Q5NCR9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nsrp1Q5NCR9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nsrp1Q5NCR9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nsrp1Q5NCR9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nsrp1Q5NCR9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nsrp1Q5NCR9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms