Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC83

Spata48, Spermatogenesis-associated protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata48Q5NC83 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spata48Q5NC83 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spata48Q5NC83 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spata48Q5NC83 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spata48Q5NC83 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spata48Q5NC83 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spata48Q5NC83 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spata48Q5NC83 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spata48Q5NC83 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spata48Q5NC83 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spata48Q5NC83 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spata48Q5NC83 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spata48Q5NC83 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spata48Q5NC83 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spata48Q5NC83 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spata48Q5NC83 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Spata48Q5NC83 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spata48Q5NC83 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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