Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttf2Q5NC05 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttf2Q5NC05 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms